Sonia Del Prete
Role: Researcher
Section: Researchers and Technologists
Division: Naples
Tel: (39) 0816132481-2
E-mail: sonia.delprete@ibbr.cnr.it
URL: http://ibbr.cnr.it
CURRICULUM VITAE
| Nome | Sonia |
| Cognome | Del Prete |
| Nato | Napoli 18/01/1986 |
| Telefono | Tel. 081 6132554 Mail sonia.delprete@ibbr.cnr.it |
Profilo
Ricercatore a tempo indeterminato da novembre 2022.
Esperienza decennale nel settore biotecnologico.
Esperienza nel campo della biochimica, dell’enzimologia e della biologia molecolare, in particolare in relazione allo studio di enzimi e proteine in diversi organismi modello. Negli ultimi anni, le sue attività di ricerca si sono concentrate sullo studio della clonazione, espressione e purificazione di diverse proteine da vari organismi e microrganismi utilizzando le tecniche analitiche più comuni come HPLC e FPLC per applicazioni in campo biotecnologico e biomedico. Ha pubblicato più di 80 articoli su riviste internazionali peer-reviewed e ha preso parte a diversi congressi nazionali e internazionali.
Settori di esperienza
Conoscenza e ottimizzazione dei processi di produzione di enzimi provenienti da organismi termofili e non termofili, essendo così in grado di fornire una vasta gamma di servizi nei seguenti settori:
- Biomedico
- Chimico-farmaceutico
- Biotecnologico
- Ambientale
Esperienze professionali
| Assegnista post doc IBBR-CNR-Napoli Dal 2020 ad oggi | |||
| PROGETTO NUTRABEST: SVILUPPO DI PIATTAFORME CELLULARI E MOLECOLARI PER L’IDENTIFICAZIONE DI PRODOTTI INNOVATIVI AD ATTIVITA’ NUTRACEUTICA DA BIOTRASFORMAZIONI DA ORGANISMI ESTREMOFILI Principali attività svolte: - Identificazione di prodotti ad attività nutraceutica attraverso reazioni di biotrasformazione mediante tecniche cromatografiche - PCR - RT-PCR - HPLC - FPLC - CRESCITE BATTERICHE | |||
| Ricercatore III livello IBBR-CNR-Napoli | |||
| Dal 2017 ad 2020 | Biocattura della co2 da miscele di gas utilizzando enzimi da microorganismi moderato termofili ed il suo impiego per la coltivazione intensiva di microalgfhe da utilizzarsi per la produzione di biocombustibili Principali attività svolte: - Identificazione dei geni codificanti per gli enzimi nel DNA genomico di microorganismi moderati termofili. - Produzione dei geni per via sintetica. - Clonaggio dei geni in vettori di espressione. - Espressione dei geni in cellule di E.coli o altri ospiti. - Purificazione mediante tecniche cromatografiche (cromatografia di affinità manuale o automatizzata, cromatografia a scambio ionico, cromatografia per setaccio molecolare) dell’enzima prodotto dal gene sintetico. - Immobilizzazione covalente su nanoparticelle magnetiche dell’enzima purificato, da destinarsi all’uso in bioreattori | ||
| Dottorato di ricerca in Scienze Farmaceutiche IBBR - CNR - Napoli | |||
| 2013 - 2016 | Studio dei parametri cinetici, dei profili di inibizione e di attivazione delle anidrasi carboniche ricombinanti prodotte da organismi patogeni. Attività svolte: - Produzione dei geni delle Anidrasi Carboniche mediante la tecnologia del DNA ricombinante (Digestione DNA con enzimi di restrizione, PCR, elettroforesi su gel di agarosio, lettura spettrofotometrica mediante Nanodrop ND1000). - Espressione dell’enzima Anidrasi Carbonica mediante crescita batterica utilizzando come sistema modello E.coli o altri ospiti. - Purificazione dell’enzima espresso medinate FPLC o HPLC. - Saggi colorimetrico di attività enzimatica. - Saggi di inibizione e attivazione dell’enzima mediante lo strumento Stopped-Flow. | ||
| Borsista CNR - Napoli | |||
| Giugno 2012-Ottobre 2013 | Clonaggio, espressione e purificazione di Anidrasi Carboniche da Vibrio Cholerae. | ||
| Le attività eseguite : - Produzione dei geni delle Anidrasi Carboniche mediante la tecnologia del DNA ricombinante (Digestione DNA con enzimi di restrizione, PCR, elettroforesi su gel di agarosio, lettura spettrofotometrica mediante Nanodrop ND1000). - Espressione dell’enzima Anidrasi Carbonica mediante crescita batterica utilizzando come sistema modello E.coli o altri ospiti. - Purificazione dell’enzima espresso medinate FPLC o HPLC. - Saggi colorimetrico di attività enzimatica. - Nuova tecnica sviluppata con il mio gruppo di ricerca: Protonografia. | |||
| Stagista CNR - Napoli | |||
| Gennaio 2011-Dicembre 2011 | Ricerche per il miglioramento della flutticoltura meridionale FRUMED | ||
| Le attività eseguite : - Estrazione di proteine da piante attraverso metodologie tradizionali, quali metodica del fenolo. - Tecnica del DIFFERENTIAL DISPLAY per identificare geni differenzialmente espressi in piante infette. | |||
| Tirocinante CNR - Napoli | |||
| Novembre 2008 - Dicembre 2010 | Espressione della 5-Lipoossigenasi ricombinante in cellule eucariotiche e determinazione dei parametri cinetici | ||
| Attività svolte: - Produzione della 5-lipossigenasi mutata per mutagenesi sito specifica. - Confronto fra 5-lipossigenasi wild-type e mutata attraverso saggi cinetici effettuati all’HPLC. | |||
Educazione
Dottorato di ricerca in Area del Farmaco e trattamenti innovativi curriculum Scienze Farmaceutiche.
Laurea Magistrale in Biotecnologie Mediche presso Universita di Napoli Federico II (110 e lode)
Maggiori progetti
Nocentini A, Cadoni R, Del Prete S, Capasso C, Dumy P, Gratteri P, Supuran CT, Winum JY. Benzoxaboroles as Efficient Inhibitors of the β-Carbonic Anhydrases from Pathogenic Fungi: Activity and Modeling Study. ACS Med ChemLett. doi:10.1021/acsmedchemlett.7b00369. eCollection
Vullo D, Del Prete S, Osman SM, Alasmary FAS, AlOthman Z, Donald WA, Capasso C, Supuran CT. Comparison of the amine/amino acid activation profiles of the β- and γ-carbonic anhydrases from the pathogenic bacterium Burkholderia pseudomallei. J Enzyme Inhib Med Chem. 2018 Dec;33(1):25-30. doi: 10.1080/14756366.2017.1387544.
Angeli A, Abbas G, Del Prete S, Carta F, Capasso C, Supuran CT. Acyl selenoureido benzensulfonamides show potent inhibitory activity against carbonic anhydrases from the pathogenic bacterium Vibrio cholerae. Bioorg Chem. 2017 Dec;75:170-172. doi: 10.1016/j.bioorg.2017.09.016. Epub 2017 Sep 21.
AngapellyS, RamyaPVS, Angeli A, Del Prete S, Capasso C, Arifuddin M, Supuran CT. Development of sulfonamides incorporating phenylacrylamido functionalities as carbonic anhydrase isoforms I, II, IX and XII inhibitors. Bioorg Med Chem. 2017 Oct 15;25(20):5726-5732. doi: 10.1016/j.bmc.2017.08.047. Epub 2017 Sep 1.
Perfetto R, Del Prete S, Vullo D, Sansone G, Barone CMA, Rossi M, Supuran CT, Capasso C. Sequence Analysis, Kinetic Constants, and Anion Inhibition Profile of the Nacrein-Like Protein (CgiNAP2X1) from the Pacific Oyster Magallana gigas (Ex-Crassostrea gigas). Mar Drugs. 2017 Aug 28;15(9). pii: E270. doi: 10.3390/md15090270.
Del Prete S, Perfetto R, Rossi M, Alasmary FAS, Osman SM, AlOthman Z, Supuran CT, Capasso C. A one-step procedure for immobilising the thermostable carbonic anhydrase (SspCA) on the surface membrane of Escherichia coli. J Enzyme Inhib Med Chem. 2017 Dec;32(1):1120-1128. doi: 10.1080/14756366.2017.1355794.
Nocentini A, Vullo D, Del Prete S, OsmanSM, AlasmaryFAS, AlOthman Z, Capasso C, Carta F, Gratteri P, Supuran CT. Inhibition of the β-carbonic anhydrase from the dandruff-producing fungus Malassezia globosa with monothiocarbamates. J Enzyme Inhib Med Chem. 2017 Dec;32(1):1064-1070. doi: 10.1080/14756366.2017.1355307.
Del Prete S, Vullo D, Osman SM, AlOthman Z, Donald WA, Winum JY, Supuran CT, Capasso C. Anion inhibitors of the β-carbonic anhydrase from the pathogenic bacterium responsible of tularemia, Francisella tularensis. Bioorg Med Chem. 2017 Sep 1;25(17):4800-4804. doi: 10.1016/j.bmc.2017.07.033. Epub 2017 Jul 17
Perfetto R, Del Prete S, Vullo D, Carginale V, Sansone G, Barone CMA, Rossi M, Alasmary FAS, Osman SM, AlOthman Z, Supuran CT, Capasso C. Cloning, expression and purification of the α-carbonic anhydrase from the mantle of the Mediterranean mussel, Mytilus galloprovincialis. J Enzyme Inhib Med Chem. 2017 Dec;32(1):1029-1035. doi: 10.1080/14756366.2017.1353502.
De Vita D, Angeli A, Pandolfi F, Bortolami M, Costi R, Di Santo R, Suffredini E, Ceruso M, Del Prete S, Capasso C, Scipione L, Supuran CT. Inhibition of the α-carbonic anhydrase from Vibrio cholerae with amides and sulfonamides incorporating imidazole moieties. J Enzyme Inhib Med Chem. 2017 Dec;32(1):798-804. doi: 10.1080/14756366.2017.1327522.
Del Prete S, Vullo D, Osman SM, AlOthman Z, Supuran CT, Capasso C. Sulfonamide inhibition profiles of the β-carbonic anhydrase from the pathogenic bacterium Francisella tularensis responsible of the febrile illness tularemia. Bioorg Med Chem. 2017 Jul 1;25(13):3555-3561. doi: 10.1016/j.bmc.2017.05.007. Epub 2017 May 6.
Del Prete S, Vullo D, Zoccola D, Tambutté S, Capasso C, Supuran CT. Kinetic properties and affinities for sulfonamide inhibitors of an α-carbonic anhydrase (CruCA4) involved in coral biomineralization in the Mediterranean red coral Corallium rubrum. Bioorg Med Chem. 2017 Jul 1;25(13):3525-3530. doi: 10.1016/j.bmc.2017.05.001. Epub 2017 May 3.
Perfetto R, Del Prete S., Vullo D, Sansone G, Barone CMA, Rossi M, Supuran CT, Capasso C. Production and covalent immobilisation of the recombinant bacterial carbonic anhydrase (SspCA) onto magnetic nanoparticles. J Enzyme Inhib Med Chem. 2017. doi: 10.1080/14756366.2017.1316719.
Entezari Heravi Y, Bua S, Nocentini A, Del Prete S, Saboury AA, Sereshti H, Capasso C, Gratteri P, Supuran CT. Inhibition of Malassezia globosa carbonic anhydrase with phenols. Bioorg Med Chem. 2017 May 1;25(9):2577-2582. doi: 10.1016/j.bmc.2017.03.026. Epub 2017 Mar 18.
Del Prete S, De Luca V, De Simone G, Supuran CT, Capasso C. Cloning, expression and purification of the complete domain of the η-carbonic anhydrase from Plasmodium falciparum. J Enzyme Inhib Med Chem. 2016;31(sup4):54-59. Epub 2016 Aug 15.
Del Prete S, Vullo D, De Luca V, Carginale V, Osman SM, AlOthman Z, Supuran CT, Capasso C. Cloning, expression, purification and sulfonamide inhibition profile of the complete domain of the η-carbonic anhydrase from Plasmodium falciparum. Bioorg Med Chem Lett. 2016 Sep 1;26(17):4184-90. doi: 10.1016/j.bmcl.2016.07.060. Epub 2016 Jul 28.
Del Prete S, Vullo D, De Luca V, Carginale V, di Fonzo P, Osman SM, AlOthman Z, Supuran CT, Capasso C. Anion inhibition profiles of the complete domain of the η-carbonic anhydrase from Plasmodium falciparum. Bioorg Med Chem. 2016 Sep 15;24(18):4410-4414. doi: 10.1016/j.bmc.2016.07.034. Epub 2016 Jul 18.
Vullo D, Del Prete S, Capasso C, Supuran CT. Carbonic anhydrase activators: Activation of the β-carbonic anhydrase from Malassezia globosa with amines and amino acids. Bioorg Med Chem Lett. 2016 Mar 1;26(5):1381-5. doi: 10.1016/j.bmcl.2016.01.078. Epub 2016 Jan 29.
Del Prete S, De Luca V, Iandolo E,Supuran CT, Capasso C. Protonography, a powerful tool for analyzing the activity and the oligomeric state of the γ-carbonic anhydrase identified in the genome of Porphyromonas gingivalis. Bioorganic & medicinal chemistry 2015 Apr 11. pii: S0968-0896(15)00276-X
Vullo D, De Luca V, Del Prete S, Carginale V, Scozzafava A, Capasso C, Supuran CT. Sulfonamide inhibition studies of the γ-carbonic anhydrase from the Antarctic cyanobacterium Nostoc commune. Bioorganic & medicinal chemistry 2015 Apr 15;23(8):1728-34.
De Luca V, Del Prete S, Carginale V, Vullo D, Supuran CT, Capasso C. A failed tentative to design a super carbonic anhydrase having the biochemical properties of the most thermostable CA (SspCA) and the fastest (SazCA) enzymes. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry Feb 16:1-6
Vullo D, Del Prete S, Fisher GM, Andrews KT, Poulsen SA, Capasso C, Supuran CT Sulfonamide inhibition studies of the η-class carbonic anhydrase from the malaria pathogen Plasmodium falciparum. Bioorganic & Meicinal Chemistry. 2015 Feb 1;23(3):526-31. doi: 10.1016/j.bmc.2014.12.009.
Alafeefy AM, Ceruso M, Al-Tamimi AM, Del Prete S, Capasso C, Supuran CT. Quinazoline-sulfonamides with potent inhibitory activity against the α-carbonic anhydrase from Vibrio cholerae. Bioorganic & Meicinal Chemistry 2014 Oct 1;22(19):5133-40. doi: 10.1016/j.bmc.2014.08.015
Vullo D, Del Prete S, Osman SM, Scozzafava A, Alothman Z, Supuran CT, Capasso C. Anion inhibition study of the β-class carbonic anhydrase (PgiCAb) from the oral pathogen Porphyromonas gingivalis. Bioorganic & Meicinal Chemistry letters 2014 Sep 15;24(18):4402-6. doi: 10.1016/j.bmcl.2014.08.014
Del Prete S, Vullo D, Fisher GM, Andrews KT, Poulsen SA, Capasso C, Supuran CT. Discovery of a new family of carbonic anhydrases in the malaria pathogen Plasmodium falciparum--the η-carbonic anhydrases. Bioorganic & Medicinal Chemistry letters 2014 doi10.1016/j.bmcl.2014.08.015
Ceruso M, Del Prete S, Alothman Z, Capasso C, Supuran CT. Sulfonamides with Potent Inhibitory Action and Selectivity against the α-Carbonic Anhydrase from Vibrio cholerae. Med Chem Lett. 2014 May 23;5(7):826-30. doi: 10.1021/ml500192a.
Ceruso M, Del Prete S, AlOthman Z, Osman SM, Scozzafava A, Capasso C, Supuran CT. Synthesis of sulfonamides with effective inhibitory action against Porphyromonas gingivalis γ-carbonic anhydrase. Bioorganic & Medicinal Chemistry letters 2014 Aug 15;24(16):4006-10. doi: 10.1016/j.bmcl.2014.06.024.
De Luca V, Del Prete S, Supuran CT, Capasso C. Protonography, a new technique for the analysis of carbonic anhydrase activity. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry 2014 Jul 9:1-6.
Vullo D, Del Prete S, Osman SM, De Luca V, Scozzafava A, Alothman Z, Supuran CT, Capasso C. Sulfonamide inhibition studies of the γ-carbonic anhydrase from the oral pathogen Porphyromonas gingivalis. Bioorganic & Medicinal Chemistry letters 2014 Jan 1;24(1):240-4. doi: 10.1016/j.bmcl.2013.11.030
Del Prete S, De Luca V, Vullo D, Scozzafava A, Carginale V, Supuran CT, Capasso C. Biochemical characterization of the γ-carbonic anhydrase from the oral pathogen Porphyromonas gingivalis, PgiCA. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry 2014 Aug;29(4):532-7.
Del Prete S, Vullo D, Scozzafava A, Capasso C, Supuran CT. Cloning, characterization and anion inhibition study of the δ-class carbonic anhydrase (TweCA) from the marine diatom Thalassiosira weissflogii. . Bioorganic & Medicinal Chemistry 2014 Jan 1;22(1):531-7. doi: 10.1016/j.bmc.2013.10.045
Del Prete S , Vullo D, De Luca V, Supuran CT, Capasso C. Biochemical characterization of the δ-carbonic anhydrase from the marine diatom Thalassiosira weissflogii, TweCA. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry 2014 Dec;29(6):906-11
Del Prete S, Vullo D, De Luca V, Carginale V, Scozzafava A, Supuran CT, Capasso C. A highly catalytically active γ-carbonic anhydrase from the pathogenic anaerobe Porphyromonas gingivalis and its inhibition profile with anions and small molecules. Bioorganic & medicinal chemistry letters 2013 Jul 15;23(14):4067-71
Vullo D, Isik S, Del Prete S, De Luca V, Carginale V, Scozzafava A, Supuran CT, Capasso C. Anion inhibition studies of the α-carbonic anhydrase from the pathogenic bacterium Vibrio cholerae. Bioorganic & medicinal chemistry letters 2013 Mar 15;23(6):1636-8.
Del Prete S, Isik S, Vullo D, De Luca V, Carginale V, Scozzafava A, Supuran CT, Capasso C. DNA cloning, characterization, and inhibition studies of an α-carbonic anhydrase from the pathogenic bacterium Vibrio cholerae. Journal of Medicinal Chemistry 2012 Dec 13;55(23):10742-8
