IBBR Project #63
PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA
| Project ID | 63 |
| ID | B78C11000230001 |
| Acronym | EPIGEN |
| Project acronym and title | PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA |
| Contract | PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA CNR EPIGEN |
| Description | PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA - Sottoprogetto 8. Identificazione di varianti epigenetiche mediante studio dell’epigenoma in piante di interesse agrario - SP8.2. Modificazioni istoniche associate alle regioni di ricombinazione meiotica in Arabidopsis. Scopo: determinare il profilo epigenomico della modifica istonica H3K4me3 nelle cellule meiotiche di Arabidopsis e associarla alle regioni di ricombinazione meiotica. L’attività di ricerca si è focalizzata sull’ ottenimento del materiale necessario per applicare il metodo INTACT (Deal e Henikoff, Nat. Protoc. 2011). Pertanto sono state costituite linee transgeniche di Arabidopsis recanti sia il gene della biotinilasi (BirA) con promotore costitutivo per l’actina (ACTIN2) sia il gene NTF (Nuclear Tagging Factor) sotto il controllo del promotore meiosi-specifico AtDMC1. Una di queste linee è stata utilizzata per l’isolamento dei nuclei meiotici sui quali sono state effettuate l’analisi della modifica post-traduzionale dell’istone H3K4me3 tramite ChIPSeq e del trascrittoma con RNASeq in collaborazione con l’IGA di Udine |
| Funding body | PNR 2011-2012 |
| UOS | Portici |
| Role | Partner |
| Signatory | Pignone Domenico |
| Contact Person | Conicella Clara |
| Project Web SIte | http://www.epigen.it |
| Starting of activities | 2011 |
| Ending of activities | 2015 |
| Extension | 2016-12-31 |
| Amount (euro) | 100000.00 |
| Technological Area | ITA0AGROALIMENTARE |
| Technological Field | Intensificazione sostenibile delle produzioni agroalimentari e forestali |
